Frage von Lorbass:Hallo liebe Forumgemeinde!
Ich bin neu hier und hoffe, ihr könnt mir bei meinem Anliegen weiterhelfen. Seit einer Woche habe ich die verschiedensten Suchmaschinen und Foren durchforstet, bin aber bis heute auf keine passende Antwort gestoßen. Ich forsche z.Zt. zum Thema Bewegungsstudien und Bewegungs-Profile von Ciliaten. Zu diesem Zweck möchte ich gerne eine Bewegungsanalyse der Individuen unter dem Mikroskop aus Videos erstellen. Das Ergebnis soll ein 1. Bild der (verschlungenen) Bewegungslinien der Ciliaten sein die zwei verfolgbare Fixpunkte (Elliptischer Körper, die Brennpunkte) und 2. Bewegungsvektoren grafisch x,y-normiert Bewegungsgeschwindigkeits-Richtungsänderung bzw. das Beschleunigungsprofil darstellen können (Bewegungsmuster-Analyse).
Bei meiner Recherche bin ich auf die Funktion Motion Tracking gestoßen, doch habe ich keine Idee gefunden wie ich es in meinem Fall wissenschaftlich einsetzen kann.
Über Hinweise, Tipps und Ratschläge würde ich mich sehr, sehr freuen.
Vielen Dank,
Lorbass
P.S. eine ähnliche Fragestellung war hier schon von Nellus (nicht mehr im Forum) 2016 gestellt worden.
Antwort von prime:
Da du sicherlich nicht der erste bist der sowas macht, würde ich mal in der entsprechenden Fachliteratur schauen wie man sowas macht.. eine 5 Minuten Suche führte mich zu ImageJ + TrackMate plug-in.
Biomechanics of Tetrahymena escaping from a dead end
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5832702/
The trajectories of cells were obtained from recorded images using ImageJ software (NIH, Bethesda, MD, USA) with TrackMate plug-in.
Oder auch:
Automated Cell Tracking using Motion Prediction-based Matching and Event Handling
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6832744/
Accurate cell tracking and lineage construction in live-cell imaging experiments with deep learning
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/803205v2.full
Etwas älter:
http://www.microscopist.co.uk/wp-conten ... ie2012.pdf
Ansonsten bin ich mir sicher lässt sich mit OpenCV sowas basteln.
Antwort von TomWI:
Definitiv ImageJ/Fiji und danach etwas Mathematik ;-)
Antwort von Lorbass:
Times are changing singt Bob Dylan. Sorry, war gerade zum ersten Mal im Forum gelandet und in die Thematik noch nicht weiter eingestiegen.
Herzlichen Dank für die Verweise!!
Lorbass
