Überträgst Du den via Firewire oder etwa - gottbewahre - über USB? Letzteres könnte fatal sein, weil die Software je nach Kamera /Softwarehersteller mal den Timecode mitliefert, mal nicht. Ohne Code = keine Szenentrennung.
Aber eventuell ist Dein Problem noch banaler: hat Deine Kamera noch eine funktionierende Datum- /Zeit-Anzeige? Vor ein paar Wochen hat hier jemand genau dieselbe Frage gestellt und eine leere Pufferbatterie war dann der Grund für eine fehlende Trennbarkeit.
BG
Andreas