jop ganz einfach.
du erstellst dein logo, transpartent oder normal, macht im dem fall ja nichts aus weil es nur ein kleines logo in der ecke ist.
dann machst du eine eigene ebene und ziehst das logo rein und positionierst es in der ebene über der video datei.
hier taucht es noch leicht auf, das ist ein einfaches fade in. einfach am anfang der bildspur mit dem regler rüberziehen. dann wird es langsam eingeblendet. und dann das ebene des logo gleichlang machen wie das video. dann ist das logo das ganze video lang dabei :)